Дноуглубительные работы проходят с обязательным экологическим контролем и мониторингом, чтобы оценить их влияние на природу.
Для защиты водных биологических ресурсов дноуглубление разрешается проводить только когда нет массового нереста рыб.
Кроме того, «Росморпорт» помогает выращивать молодь разных видов рыб, чтобы компенсировать возможный вред, который может быть нанесён во время работ в морских портах.
В 2020 году выращено и выпущено в водоёмы более 3,8 млн рыб; *В 2021 - 19,1 млн; *В 2022 - 2,2 млн; *В 2023 - 4,9 млн; *В 2024 - 1,1 млн.
Среди видов: атлантический, тихоокеанский лосось (кета) и черноморский лосось, русский осетр, балтийский сиг, палия, белый толстолобик, сазан.
